พิพิธภัณฑ์วัดหนองปรือ ก่อตั้งในปี 2526 โดยพระครูพิพิธกิจจารักษ์ เจ้าอาวาสวัดหนองปรือ และรองเจ้าคณะอำเภอบางละมุง ตั้งอยู่บริเวณภายในอาคารโรงเรียนพระปริยัติธรรมของวัดหนองปรือ ชั้นล่างของอาคารแบ่งส่วนออกชัดเจนเป็น 2 ส่วน คือ ด้านหน้าเป็นห้องรับรองผู้มาติดต่อกับท่านเจ้าอาวาส ห้องพระ และมีตู้จัดแสดงพระพุทธรูปโดยรอบห้อง ส่วนด้านในเปิดประตูเข้าไปจะเป็นส่วนของพิพิธภัณฑ์แผ่นไม้ ใหญ่ที่นำมาทำเป็นเฟอร์นิเจอร์

จุดกำเนิดพิพิธภัณฑ์ ท่านเจ้าอาวาสกล่าวว่าเริ่มจากมีรถขายไม้แผ่นใหญ่ที่นำมาทำเฟอร์นิเจอร์วิ่งผ่านมา ท่านชอบจึงซื้อไว้บ้าง ได้รับบริจาคบ้าง จำนวนมากขึ้นจึงจัดเป็นพิพิธภัณฑ์ ทั้งไม้มะค่า ไม้ประดู่ ไม้สามพรซึ่งเป็นไม้มงคล โต๊ะไม้มะค่าบางชิ้นหน้าใหญ่ กว้างถึง 8 เมตร และหนักมาก นอกจากนี้ยังมีวัตถุที่ขุดพบเจอภายในบริเวณวัด อย่างเช่น ใบเสมาธรรมจักรทำด้วยหิน ซึ่งมีผู้ศรัทธานำทองคำเปลวมาติดไว้เพื่อความเป็นสิริมงคล มีพิมพ์สำหรับทำพระซึ่งทำมาจากไม้ 

บนชั้นที่ 2 ด้านหน้าจัดแสดงของเก่าที่ขุดพบทั้งในบริเวณวัด และในบริเวณหมู่บ้านโดยรอบ เช่นเครื่องถ้วยชามสังคโลกสำหรับติดหน้าบันโบสถ์ ชาวบ้านขุดพบเจอก็จะนำมาถวายที่วัด นอกจากนี้ยังมีตู้จัดแสดงสิ่งของเครื่องใช้ภายในวัด เช่น ตาลปัตร พานทอง เครื่องเงิน เครื่องทองเหลือง เครื่องแก้ว เครื่องเบญจรงค์ หม้อ ไหดิน ถ้วย ชาม โต๊ะไม้แกะสลัก แจกันคู่ที่สูงเกือบเท่าความสูงของห้อง สิ่งของส่วนใหญ่จะได้รับบริจาคมา เครื่องสำริด ที่โดนขโมยไปจนเหลือเพียงครึ่งเดียว จนท่านต้องนำของปลอมมาใส่ไว้แทน และยังมีวัตถุที่ท่านเจ้าอาวาสสะสมเองเพราะความชอบ อย่างเช่นแสตมป์ เงินเหรียญ และธนบัตรทั้งในประเทศไทย และในต่างประเทศ