พิพิธภัณฑสถานจังหวัดกำแพงเพชรเฉลิมพระเกียรติ ก่อตั้งขึ้น โดยมูลนิธิปริยัติศึกษา ญสส. ในพระสังฆราชูปถัมภ์สมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราชสกลมหาสังฆปริณายก ร่วมกับ จังหวัดกำแพงเพชร  กรมศิลปากร และกรมสามัญศึกษา จัดสร้างพิพิธภัณฑสถานแห่งนี้ขึ้นสนองแนวพระราชดำริของสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี คือ ให้มีพิพิธภัณฑ์เมืองคู่กับพิพิธภัณฑสถานศึกษา จึงจัดสร้างขึ้นเพื่อเฉลิมฉลองในวโรกาสพระราชพิธีกาญนาภิเษก ฉลองสิริราชสมบัติครบ 50 ปี พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว

ภายในหมู่เรือนไทย  4  หลัง  แบ่งการจัดแสดงออกเป็น  4 เรื่อง  (หลังละเรื่อง)  ได้แก่

1.เมืองกำแพงเพชร  จัดแสดงข้อมูลภาพ หุ่นจำลอง และวีดีทัศน์แสดงเรื่องเกี่ยวกับลักษณะทางภูมิศาสตร์ของอำเภอต่างๆ ธรรมชาติวิทยาในท้องถิ่นและโบราณคดีของจังหวัดกำแพงเพชร

2.ชาติพันธุ์วิทยาเมืองกำแพงเพชร  จัดแสดงข้อมูลภาพ หุ่นจำลอง  คอมพิวเตอร์ระบบสัมผัสจอภาพ  ให้ข้อมูลเกี่ยวกับชนกลุ่มน้อยที่ตั้งถิ่นฐานในจังหวัดกำแพงเพชร ได้แก่ กลุ่มชนม้ง เย้า กระเหรี่ยง ลิซู และเรื่องชนพื้นถิ่นในจังหวัด ประเพณีและการดำเนินชีวิตของผู้คน 

3.มรดกดีเด่นเมืองกำแพงเพชร จัดแสดงสิ่งเด่นของจังหวัดด้านทรัพยากร แร่ธาตุ ด้วยสื่อจัดแสดงที่เป็นภาพ หุ่นจำลอง และคอมพิวเตอร์สัมผัสจอภาพ 

4.ห้องบรรยาย เป็นห้องบรรยายรวมและจัดประชุม มีจอฉายวีดีทัศน์เรื่องเมืองกำแพงเพชร  ภายในจัดแสดงผลงานศิลปหัตถกรรมของชาวกำแพงเพชร อาทิ วิถีชีวิต กลุ่มชนเผ่า ภูมิปัญญา ผลงานศิลปะ ธรรมชาติศึกษาและสิ่งมีชีวิต

ส่วนบริเวณโดยรอบจัดแสดงพันธุ์ไม้โบราณ  โดยเฉพาะสวนส่วนหลังของบริเวณจัดเป็นศูนย์รวมพันธ์ุกล้วยกว่า 100  สายพันธุ์