ภายในพิพิธภัณฑ์แห่งนี้ ได้จัดแสดงอัญมณีและเครื่องประดับแบบครบวงจร โดยมีแนวคิดให้ผู้ที่มาเยี่ยมชมได้ศึกษา ตั้งแต่การกำเนิดของอัญมณี อันเป็นต้นธารไปจนถึงปลายธารที่อัญมณีได้อยู่คู่กับตัวเรือนโลหะมีค่า กลายเป็นเครื่องประดับที่สูงค่าในที่สุด มีการจัดแสดงแหล่งกำเนิดอัญมณี ประเภทต่างๆ การเจียระไน การจัดระดับมาตรฐานคุณภาพอัญมณี โลหะมีค่า กระบวนการผลิตเครื่องประดับ ทองคำ แพลทินัม และเงิน รวมทั้ง จัดแสดงอัญมณีสังเคราะห์ อัญมณีเลียนแบบ และแก้วผลึก

การจัดแสดงนิทรรศถาวรของพิพิธภัณฑ์อัญมณีและเครื่องประดับ ประกอบด้วย

     โซน A : การกำเนิด และเหมืองพลอยในประเทศไทย
     โซน B : ประเภทอัญมณี
     โซน C : เพชร
     โซน D : การเจียระไนเพชร เจียระไนพลอย
     โซน E : อัญมณีอินทรีย์
     โซน F : อัญมณีสังเคราะห์
     โซน G : เหมืองทองและโลหะมีค่า
     โซน H : เครื่องประดับอัตลักษณ์ไทย
     และสื่อ Interactive ต่างๆ เพื่อเพิ่มมิติการเรียนรู้ด้านอัญมณีให้สนุกยิ่งขึ้น